mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTCGGCGTGGCGTCGGTCGTG CGACCGGACCTCGACCGGCTCG CATCAAGAGTCGGCTGAGTCACTGCCACTGCCTACCAATCTCGACCGGACCTCGACCGGCTCGTCTATATTGCCAATCGACTCGGCGTGGCGTCGGTCGTGGTAGATAGGCGGTCATACAGACGAGTTTTCAAGTGTTGCTCTGGTGAC 5 2 3' arm Bos_taurus mirbase mir-1307 8e-37 hsa-mir-1307 5e-50 -52.14 (((((.(((.((((((((((.(((..((((((((.(.(((.(((((((.((.((.(((..(((..............)))..))))).))..))))))).))).).))))))))....)))..))...))))...)))))))))))).. (-52.14)