mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCTGAGTACTCTCTTCCAAA TGGGGGAGGGCTCAGGAAG TGTTTTTATTTTGTTTCTGTGATGTGTTTTGTCCTGAGTACTCTCTTCCAAATTTGGTCACACAGTGGACTATGTGATTTAAGTTTGGGGGAGGGCTCAGGAAGTGTGTGTTGCATTGTCTAGAATCTTGAG GGGCATTCTCCGCAGCACAAAGGGAAAGAAGGGCCTGAAGGGCGACCTCAATGATGCACCACCAGTTATGCTTCTGTTGATCCACCTGGGTAGATATAGGAAGTGGGCGCACACCAACGGGAAGAACAGGTCGCCAGGAGCCCTTTGTTTGGTGTACCTTTCACGTCTCCAGGGTTCGATCCGAGGATGATAGACTTAGATCACTTGCGTCGTTGTGAGTTTCTGGAGCACGACATGGTCGGCGATTTCTATCGCTACAAATTCGAGCACTCCTTTACCCGAACAGCCAACATTCTGCTTCCCTGCACTAAGGCCACAACCATATTCCAGGGCGAAAACATTAACATCAAGCCTGCGCGTGATTACCTTTACTTTGAGAGCGGTGCTGACCGCGACGAAGGAGCAGAGGTCGAGTACCCCCAGGGGGGAAGCTGAGACACAACAGGGAGATTCTTCGATGGCCTAGGAGCAATCACAGGCAGCTATTGACGACCAACTCCGCTCCTTTTTCCACTGAGGTAAACACCTCACTTCACCATTGTAATATACCATCTCTTGTTTTTATTTTGTTTCTGTGATGTGTTTTGTCCTGAGTACTCTCTTCCAAATTTGGTCACACAGTGGACTATGTGATTTAAGTTTGGGGGAGGGCTCAGGAAGTGTGTGTTGCATTGTCTAGAATCTTGAGTCTGCATTCATTTAAGGCATAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 0 2 5' arm Arabidopsis_thaliana mirnest MIR854 0.000000000002 100 -39.9 ..........(((.((((((((((((.....((((((((..(((((((((((((((((((((.((....)).))))).)))))))))))))))))))))))).........)))))))..)))))...))). (-39.9)