mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTGTGGTTTTGGATGTCTG ACTTTCAAAACTCAGGAGT GCAGTATATGACTCACTTTCAAAACTCAGGAGTCACATTTGTCTTGTGTGGTTTTGGATGTCTGGTAGTATTGT 4 1 3' arm Bos_taurus mirbase 100 100 -20.4 (((((((...(((.((.(((((((((((.(((.((....)).))).)).))))))))).))..))).))))))) (-20.40)