mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCTGAGTACTCTCTTCCAAA TGGGGGAGGGCTCAGGAAG TACCATCTCTTGTTTTTATTTTGTTTTTGTGATGTGTTTTGTCCTGAGTACTCTCTTCCAAATTTGGTCACACAATGGACTGTGTGATTTAAGTTTGGGGGAGGGCTCAGGAAGTGTGTGTTGCATTGTATATAATTTTGAGTCTGCATTCA GCGGGAACAGGGAGATTCTTCGATGGCCTGGGAGCAATCATAGGCAGCTATTGACGACCAACTCCGCTCCTTCTTCCACTTAGGTATGCACCTCACTCCACCATTGTAATATACCATCTCTTGTTTTTATTTTGTAATATACCATCTCTTGTTTTTATTTTGTTTTTGTGATGTGTTTTGTCCTGAGTACTCTCTTCCAAATTTGGTCACACAATGGACTGTGTGATTTAAGTTTGGGGGAGGGCTCAGGAAGTGTGTGTTGCATTGTATATAATTTTGAGTCTGCATTCATCTAAGGCATAGAAAAAACAAAAAAAATGAAAAATTTCAGAAAATGATTTCACAAAAATAGAGTGCTCATGTAGTTGTAAGCATTTAGGATCGAGTCTAGAGTGTTTCATGTAGGATTTTTGCATTTGCATAGGGGATAATGATGAGATAGCCTTGTAAGCATTTTGGTTCACCAGATAAGCTCAGTGCCCTCGTTGTTAGTTGTCTGATGCGTAGCCATTGAAATTGAAGTAAAACTGCACCATGCCTAGATTGCTCTACTCGACCACACTATTAGGATCTGATACCATTCCCTATCAATTTGAACTTGAATCTGATTTAGAATTATCATGTCTTGGCATCGAATTTGAACTCATGGATACCCTAAAATACTTGGATTTTCTTACTCATTTTAAACACTCTTGTTAGTCCAAGTAGCTGACTCTCCTTATTAGAGTAGTTAACCCGAACCCAAACCTAAACTTTCTTTCAAACCCTATATCACTTGTGAGTG 0 2 5' arm Arabidopsis_thaliana mirnest MIR854 1e-17 100 -44.4 ..........(((.((((..((((...(((((((((.....((((((((..(((((((((((((((((((((((......))))))).)))))))))))))))))))))))).........))))))))).))))...))))...))).... (-44.4)