mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCTGAGTACTCTCTTCCAAA TGGGGGAGGGCTTAGGAAG ATGTGTTTTTGTCCTGAGTACTCTCTTCCAAATTTGGTCACACAGTGGACTGTGTGATTTAAGTTTGGGGGAGGGCTTAGGAAGTGTGTGTT GGTGCTGGCTGCAGCAGAAGAAGAGAGGTCGAGTATCATCAGAGCGGTGCTGGCCGCGACGAAGGAGCAGAGGTCGAGTACCCCCAGGGGGAAGCTGAGACACAACAGGGAGATTCTTCGATGGCCTGGGAGCAATCACAGGCAGCTATTGACGACCAACTCCGCTCCTTCTTCCACTGAGGTATGCACCTCACTCCACCATTGTAATATACCATCTCTTGTTTTTATTTAGTTTTTGTGATGTGTTTTTGTCCTGAGTACTCTCTTCCAAATTTGGTCACACAGTGGACTGTGTGATTTAAGTTTGGGGGAGGGCTTAGGAAGTGTGTGTTGCATTGTATAATCTTGAGTCTGCATTCATCTAAGGCATAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 0 2 5' arm Arabidopsis_thaliana mirnest MIR854 0.000005 100 -36.3 ...........((((((((..((((((((((((((((((((((((....)))))))).)))))))))))))))))))))))).......... (-36.3)