mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCGCGCTCTACGCCAGC TGGTGCAGGCCGCGGAGCC CGCCGCTCCGCTCCCGGTTCCGCGCTCTACGCCAGCCCGCTGCCTGCCGGGCTGGTGCAGGCCGCGGAGCCGGGCGGCCCGGCAGGCA 3 0 5' arm Bos_taurus mirbase 100 100 -64.4 .((((((..(((((((((((((((..((.(((((((((((.....).)))))))))).))..)))))))))))).)))..))).))). (-64.40)