mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAACCAATGTGCAGACTACTGT GGTAGTCTGAACACTGGGTTGG CCCAGCCTAACCAATGTGCAGACTACTGTACACATTCAGAGCCCCCTGAACAGGTAGTCTGAACACTGGGTTGGCGGG 7 0 5' arm Bos_taurus mirbase mir-199 1e-30 ssc-mir-199a-2 5e-39 -33.5 (((.(((...(((.(((.(((((((((.......(((((......)))))..))))))))).))).)))...)))))) (-33.50)