mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAACCAATGTGCAGACTACTGT AGATAGTCTAAACACTGGGTAGA CAGCCTAACCAATGTGCAGACTACTGTACAATTTGGGAGTCCTGAACAGATAGTCTAAACACTGGGTAGACGG 4 1 5' arm Bos_taurus mirbase mir-199 8e-35 hsa-mir-199b 5e-36 -21.1 ..(.(((.(((.(((..((((((((((.....(..((...))..))))).))))))..))).))).))).).. (-21.10)