mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCGGATCCGTCTGAGCTTGGCT CTGAAGCTCAGAGGGCTCTGATTC GCTTTGATCACTGTCTCCAGCCTGCTGAAGCTCAGAGGGCTCTGATTCAGAAAGATCATCGGATCCGTCTGAGCTTGGCTGGTCGGAAGTCTCCTCATCTGCTTCCTTCGGGTT 3 1 3' arm Ovis_aries mirbase mir-127 1e-34 mml-mir-127 6e-49 -43.7 ((..(((..(((...(((.(((.(((.(((((((((.((.((((((((.....))..)))))).)).)))))))))))).))).))))))....)))...))..((....)).. (-43.70)