mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTCCATTTGTTTTGATGATGGA CATCATCGTCTCAAATGAGTCT TCGGATGAGCCCTCGGAGGACTCCATTTGTTTTGATGATGGATTCTTACGCTCCATCATCGTCTCAAATGAGTCTTCAGAGGGTTCTATCAT 3 1 5' arm Ovis_aries mirbase mir-136 5e-40 mml-mir-136 1e-43 -48.1 ...(((((((((((.((((((((.(((((...((((((((((.........))))))))))...))))))))))))).)))))))).))).. (-48.10)