mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCAATACACGGTCGATCTCT AGGTTGTCCGTGGTGAGTT CCAGCAGTGCTGCCTCACGGTACTTGGAGGGAGGTTGTCCGTGGTGAGTTTGCATTGTCTAATGATGCCCAATACACGGTCGATCTCTTTTCGGTATCAGATTGCACCGG 3 2 3' arm Ovis_aries mirbase mir-154 2e-24 hsa-mir-323b 1e-28 -39.5 ....(.((((....((..((((((.((((((((((((.(((((.((.((...((((....))))..)).))...))))).)))))))))))))))))).))..)))).). (-39.50)