mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACACACCTGGTTAACCTTTTT AGAGGTTTTCTAGGTCTCCGTTTC TGTAATTGGTGGTACTTGAGGAGAGGTTTTCTAGGTCTCCGTTTCTTTCATGAGGATGAAACACACCTGGTTAACCTTTTTTCCAGTATCAGATCCCACCTTGG 4 2 3' arm Ovis_aries mirbase mir-154 1e-31 oar-mir-329a 2e-54 -37.41 .......(((((((((.(((((((((((..((((((....(((((.(((....))).)))))..))))))..))))))))))).)))).......))))).... (-37.41)