mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAGGTTTTCTGGGTTTCTGTTTC AACACACCTGGTTAACCTCTT CACTGGTGTTCTGGTCAGTGTTCACCCATGGTACCTGAAGAGAGGTTTTCTGGGTTTCTGTTTCTTTAATGAGGATGAAACACACCTGGTTAACCTCTTTTCCAGTATCAAATCCCATCTTGAA 5 2 5' arm Ovis_aries mirbase mir-154 2e-31 oar-mir-329b 3e-66 -40.7 ((((((........))))))........((((((..(((((((((((..(..(((...((((((.((......)).)))))).)))..)..)))))))))))..)))))).............. (-40.70)