mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGTAACACGGTCCACTAACT ATGGTAGACTATGGAACGTAGG CCTGATTCTGGGGTCAGCACCACTCCACGGTTCCTGCAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCTGTGTGATTTCTGACCTATGTAACACGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCGTCCTCGGA 6 0 3' arm Ovis_aries mirbase mir-154 1e-28 oar-mir-379 2e-67 -39.9 .((((((....))))))...........((...(((.((((.((((.(((..((..((((((((.(........).).)))))))..))..))).)))).)))))))...))..((((....)))) (-39.90)