mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGTAATGTGGTCCACGTCT ATGGTTGACCACAGAACATGCG CCTTCCCACGGTACCTGAAAAGATGGTTGACCACAGAACATGCGCTGTCTCTATGTCGTATGTAATGTGGTCCACGTCTTCTCAATATCAAATTCAGTCGCAG 4 1 3' arm Ovis_aries mirbase mir-154 1e-31 oar-mir-380 9e-54 -32.1 .........((((..(((.((((((...(((((((..((((((((.........).)))))))..)))))))..)))))).))).)))).............. (-32.10)