mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCGAGGTTGCCCTTTGTAT ACAAGGGCAAGCTCTCTGT AGCGATGGACCTGCCCAATGCTACTACTGTTTGGTACTTAAAGCGAGGTTGCCCTTTGTATATTCGGTTTTTTGACGCAGAATATACAAGGGCAAGCTCTCTGTGAGTATCAAACCCTGGACCCAGTC 2 1 5' arm Ovis_aries mirbase mir-154 2e-27 oar-mir-381 1e-68 -54.3 ((((.(((......))).))))......((((((((((((.((.(((.((((((((.((((((((.(((....)))...)))))))))))))))).))).)).)))))))))))).(((....))).. (-54.30)