mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGAATGTTGCTCGGTGAACCCCT AGGTTACCCGAGCAACTTTGCA CCTCTCCATGGTACGCGGGGAGAGGTTACCCGAGCAACTTTGCATCTGGACGACGAATGTTGCTCGGTGAACCCCTTTTCGGTATCAAAATCCATCAGAGA 3 1 3' arm Ovis_aries mirbase mir-154 3e-32 oar-mir-409 1e-52 -39.6 .((((...((((((.((..(((.((((..((((((((((((((........).)))).)))))))))..)))).)))..)))))))).........)))). (-39.60)