mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGTAACACGGTCCACTAAC TAGTAGACCGTATAGCGTACG CCCCAGCCTCTGTCCTCGGCGTCCCTGTGTGGTACTCGGAGAGATAGTAGACCGTATAGCGTACGCTTTATCTGTGACGTATGTAACACGGTCCACTAACCCTCAGTATCAAATCCGTCCTCGAG 4 0 3' arm Ovis_aries mirbase mir-154 3e-36 oar-mir-411a 8e-67 -36.3 ..............(((((.(..(.....(((((((..(((.(.((((.((((((.(.((((((((.........).))))))).).)))))).)))).).)))))))))).....)..)))))) (-36.30)