mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGTCGACCAGTTGGAAAGTAAT GTACTTCACCTGGGCCACTAGC AGGGAAGAACGTCAGTACCAGCAACCACTCTGGGGTACAGGACGGATGGTCGACCAGTTGGAAAGTAATTGTTTCTAATGTACTTCACCTGGGCCACTAGCTGTCCGTACCCACTGCAGCCTGC 3 3 5' arm Ovis_aries mirbase mir-412 2e-27 oar-mir-412 3e-66 -35.8 .(((......(.((((.((((........))))(((((.((((((.((((.(.((((.(((..((((((((....)))).))))))).)))).).)))).))))))))))).)))))..))).. (-35.80)