mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTCATACACGGCTCTCCTCTCT AGAGGCTGGCCGTGATGAATTC CAAGTGTCCACTTATGGTACTTGAAGAGAGGCTGGCCGTGATGAATTCGATTCATCAAAGCGAGTCATACACGGCTCTCCTCTCTTTTAGTGTCAAATTCTGCCTCGGAGG 2 2 3' arm Ovis_aries mirbase mir-154 4e-38 oar-mir-485 2e-58 -42.3 .((((....)))).((..(((.(((((((((..(((((((((((.((((...........)))))))).)))))))..))))))))).)))..))..(((((...))))). (-42.30)