mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGGACACATGGTCTACTTCT ACGCGGTTGACCATGGTGTGTACG GAGGCGAGGTCGGCATCCCTTCCTGGTATTTGAAGACGCGGTTGACCATGGTGTGTACGCTTTATTTATGACGTAGGACACATGGTCTACTTCTTCTCGATATCACATCTTCGCCTTGGAAGACCTTCC 5 3 3' arm Ovis_aries mirbase mir-154 9e-27 oar-mir-1197 3e-69 -42.6 (((((((((..((....))....(((((((.(((((...(((.(((((((...(.(((((.........).)))).)...))))))).))))))))..)))))))...)))))))))((((....)))) (-42.60)