mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGATATTGCACGGTTGATCTCT AGGTTGTCCGTGATGTATTTGC CTGGTCTGAGATGTTCGAAAGGAGGTTGTCCGTGATGTATTTGCTTTATTTGTGGCAGATATTGCACGGTTGATCTCTTTTCTTCATCAAATGCCTTCTTGAAG 3 0 3' arm Ovis_aries mirbase mir-154 5e-31 oar-mir-3958 2e-54 -39.3 ..(((.(..((((...((((((((((((.(((((..(((((((((........)))))))))..))))).))))))))))))..))))..).)))......... (-39.30)