mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGTTGATCAGAGAACATACATT TGTATGTCAACTGATCCACAGT ATGGTCCGTGATAGGGGAGTGGATGGTTGATCAGAGAACATACATTTTGTCAATGATGTATGTCAACTGATCCACAGTCCCTCCCTATCCAGTCACTTCTC 5 0 5' arm Ovis_aries mirbase 100 oar-mir-3959 1e-52 -40 .......(((((.((((((.((((.((.((((((...(((((((((........)))))))))...)))))).)).)))))))))).....)))))..... (-40.00)