mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC TGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCGTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACT 3 0 5' arm Sus_scrofa mirbase let-7 1e-31 mmu-let-7c-1 5e-46 -43.3 .((((((.((((((..(((.(((.(((((((((((((..((.(..(.....)..).))))))))))))))).))).)))..)))))))))))). (-43.30)