mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGTA CATACTTCTTTATGTGCCCATA CCGGTTGACGTACCTGCTTGGGGGACATACTTCTTTATGTGCCCATATGGACCTGCTAAGCTATGGAATGTAAAGAAGTATGTATTTCAGGCTGGGAACTCTCACCGG 2 1 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-1 8e-27 bta-mir-1-1 7e-33 -46.5 (((((.((.((.((((((((..(.((((((((((((((((..((((((((.....)))...))))).)))))))))))))))).)..))))).))).))))..))))) (-46.50)