mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCAGCACGTAAATATTGGCG CCAATATTATTGTGCTGCTTTA TCCGCTCTAGCAGCACGTAAATATTGGCGTAGTAAAATAAATATTAAACACCAATATTATTGTGCTGCTTTAGCGTG 4 0 5' arm Sus_scrofa mirbase mir-16 2e-32 eca-mir-16 5e-36 -30.5 ..((((..(((((((((..((((((((.((((((.......))))..)).))))))))..)))))))))..)))).. (-30.50)