mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCAGCACGTAAATATTGGCG CCAGTATTAACTGTGCTGCTGAA CAGTGCCTTAGCAGCACGTAAATATTGGCGTTAAGATTCTAAAATTATCTCCAGTATTAACTGTGCTGCTGAAGTAAGG 2 1 5' arm Sus_scrofa mirbase mir-16 6e-36 age-mir-16 1e-39 -28.2 ...(((.((((((((((((.((((((((.(.(((..........))).).)))))))).)).)))))))))).)))... (-28.20)