mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTGCAGTGAAGGCACTTGTAG AAAGTGCTTACAGTGCAGGTAG GAATAATGTCAAAGTGCTTACAGTGCAGGTAGTGATAATGTGCATCTACTGCAGTGAAGGCACTTGTAGCATTATGG 5 1 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-17 1e-21 ssc-mir-17 2e-38 -29.4 ..(((((((..((((((((.((.(((((.(((((........)).)))))))).)).))))))))...))))))).. (-29.40)