mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGCTGCCAGTTGAAGAACTGT AGTTCTTCAGTGGCAAGCTTTA GAGCCGCAGTAGTTCTTCAGTGGCAAGCTTTATGTCCTGACCCAGCTAAAGCTGCCAGTTGAAGAACTGTTGCCCTCTGC 0 2 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-22 6e-39 eca-mir-22 4e-40 -34.7 (((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).)))... (-34.70)