mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTACAAGGAGTCAAGCATG GTTTGTCGTTATGCCTGGCTCCCTGTATGCCACGAGTGGATACCGATTTTGGTTTTAAAATCGGCTGCCGGCTGGCGTACAAGGAGTCAAGCATGACCAGAAG AAAAACTCTTCAACATTTCTCTCTGACCTACTTCATTTCCTCTTCCCAACAGTTAAAAAAAGTTCTGATTCGATTCAAGCCAAGATCCACGTATAAAGATATGTTCATGCGTAGAGGTTTGGTATACAAAAATATATACATATAATAGTTTGTCGTTATGCCTGGCTCCCTGTATGCCACGAGTGGATACCGATTTTGGTTTTAAAATCGGCTGCCGGCTGGCGTACAAGGAGTCAAGCATGACCAGAAGCATATGGTAACTCAATTGCATCTACAACTAAATATGAAATATCTAGCTTATGTATATGGTTGGTGTCCTATAAGATGTTTTCTTCGAATTTGGATTTTGGTGTTCCATTTGAATAAGCAAACAGAAATAAAACCAAGTTTGGTAGTTTTTTG 3 0 5' arm Arabidopsis_thaliana mirnest mir-160 8e-39 ath-MIR160c 3e-41 -44 .((((..(((((((.(((((((.((((((((.((.((((...(((((((((....)))))))))))))))...)))))))).))))))).))))))))))).. (-44)