mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCACAGTGGCTAAGTTCCGC AGGGCTTAGCTGCTTGTGAGCA TGGCCTGGGGAGCAGGGCTTAGCTGCTTGTGAGCAGGTCCACAGCAAGTCGTGTTCACAGTGGCTAAGTTCCGCCCCCTGGA 3 1 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-27 9e-29 bta-mir-27a 3e-34 -44.7 ...((.((((.((.(((((((((..((.(((((((.(.(........).).)))))))))..))))))))).)))))).)). (-44.70)