mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCACAGTGGCTAAGTTCTGC AGAGCTTAGCTGATTGGTGAACA ACGAGGTGCAGAGCTTAGCTGATTGGTGAACAGTGACTGGTTTCCGCTTTGTTCACAGTGGCTAAGTTCTGCACCTGAAG 2 2 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-27 5e-27 bta-mir-27b 4e-40 -41.3 ...((((((((((((((((((....((((((((....(((...)))..))))))))..)))))))))))))))))).... (-41.30)