mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCACCATTTGAAATCAGT TGGTTTCATATGGTGGTTTAGA CTTCAGGAAGCTGGTTTCATATGGTGGTTTAGATTTAAAAAGTGATTGTCTAGCACCATTTGAAATCAGTGTTCTTGGGGG 1 2 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-29 5e-24 eca-mir-29b 2e-38 -34.02 (((((((((((((((((((.((((((..((((((.............)))))))))))).)))))))))).))))))))). (-34.02)