mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTTCAGTCGGATGTTTACAGC TGTAAACATCCTTGACTGGAAGCT TTTGCCACTGTAAACATCCTTGACTGGAAGCTGTGAGGCGTTCCCAGGAGCTTTCAGTCGGATGTTTACAGCGGCAGGCT 1 2 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-30 3e-16 ssc-mir-30e 4e-40 -45.9 .(((((.((((((((((((..(((((((((((.(..((....))..).))))))))))))))))))))))).)))))... (-45.90)