mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCAACGGGTATTTATTGAGCA CTCAATAAATGTTTGTTGAATT AACACAGTGGGCGCTCAATAAATGTTTGTTGAATTGAGATGCGTTAAATTCAACGGGTATTTATTGAGCACCCACTCTGTG 3 0 3' arm Sus_scrofa mirbase 100 cfa-mir-95 5e-36 -41.5 .(((.((((((.((((((((((((..(((((((((...........)))))))))..)))))))))))).)))))).))). (-41.50)