mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAAGTTGTATTGTT CTATACAACTTACTACTTT GGGTGAGGTAGTAAGTTGTATTGTTGTGGGGTAGGGATTTTAGGCCCCAATTAGAAGATAACTATACAACTTACTACTTT 2 0 5' arm Sus_scrofa mirbase let-7 2e-35 eca-mir-98 4e-40 -31.3 ....(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))))))))))))) (-31.30)