mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACCCGTAGATCCGAACTTGTG CAAGCTTGTGTCTATAGGTATG AGGCCTGTTGCCACAAACCCGTAGATCCGAACTTGTGCTGATAGTGCACACAAGCTTGTGTCTATAGGTATGTGTCTGTG 6 0 5' arm Sus_scrofa mirbase mir-10 9e-26 mmu-mir-100 5e-33 -25.3 ...........((((.(((..((((..(((.((((((.((......)))))))).)))..))))..))).))))...... (-25.30)