mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACAGTACTGTGATAACTGAA CAGTTATCACAGTGCTGATGCT GGCTGCCCTGGCTCAGTTATCACAGTGCTGATGCTGTCCATTCTAAAGGTACAGTACTGTGATAACTGAAGGATGGCAGCC 1 1 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-101 9e-29 oan-mir-101-1 9e-41 -45.4 (((((((.....((((((((((((((((((.((((............)))))))))))))))))))))).....))))))) (-45.40)