mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCAGCATTGTACAGGGCTATGA GGCTTCTTTACAGTGCTGCCTTG CTTACTGCCCTCGGCTTCTTTACAGTGCTGCCTTGTTGCATATGGATCAAGCAGCATTGTACAGGGCTATGAAGGCACTGAG 1 4 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-103 4e-34 mmu-mir-103-1 6e-39 -33.4 ((((.((((.((((((.((.(((((((((((.(((.(.(....).).)))))))))))))).))))))..)).)))).)))) (-33.40)