mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCAGCATTGTACAGGGCTATGA AGCTTCTTTACAGTGCTGCCTT TGTGCTTTCAGCTTCTTTACAGTGCTGCCTTGTAGCATTCAGGTCAAGCAGCATTGTACAGGGCTATGAAAGAACTAAGA 2 3 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-103 1e-33 cfa-mir-103-2 3e-37 -28.5 .((.(((((((((.((.(((((((((((((((.......))))....))))))))))).)))))..)))))).))..... (-28.50)