mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAAATGCTCAGACTCCTTG CGGATGTTTGAGCATGTGCTA TGTGCATCGTGGTCAAATGCTCAGACTCCTTGGTGGCTGCTTATGCACCACGGATGTTTGAGCATGTGCTATGGTGTCTA 5 1 5' arm Sus_scrofa mirbase mir-105 9e-32 bta-mir-105b 9e-38 -39.2 ...(((((((((.((.(((((((((((((...((((.(((....)))))))))).)))))))))).)))))))))))... (-39.20)