mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCAGCATTGTACAGGGCTATCA AGCTTCTTTACAGTGTTGCCTTG TTCTCTCTGCTTTCAGCTTCTTTACAGTGTTGCCTTGTGGCATGGAGTTCAAGCAGCATTGTACAGGGCTATCAAAGCACAGAGAGC 4 2 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-103 4e-34 mmu-mir-107 6e-42 -35.1 ((((((.((((((.((((.((.(((((((((((.(((.(((.....))))))))))))))))).))))))...)))))).)))))). (-35.10)