mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGCACGCGGTGAATGCCA GTGTTCACAGCGGACCTTGAT TCAAGACCAGACTCTGCCCTCCGTGTTCACAGCGGACCTTGATTTAATGTCATACAATTAAGGCACGCGGTGAATGCCAAGAGCGGAGCCTACGGCTGCACTTGA 5 0 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-124 9e-39 mml-mir-124a-1 2e-48 -38.1 (((((..(((.((((((.((..((((((((.(((..((((((((...........))))))))..))).))))))))..)).)))))).......)))..))))) (-38.10)