mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCCTGAGACCCTAACTTGTGA ACGGGTTAGGCTCTTGGGAGCT CCTCTCAGTCCCTGAGACCCTAACTTGTGATGTTTACCGTTTAAATCCACGGGTTAGGCTCTTGGGAGCTGCGAGCCGTG 6 0 5' arm Sus_scrofa mirbase lin-4 9e-29 age-mir-125b-1 9e-38 -35.8 .(((.(((..((..(((.(((((((((((..(((((.....))))).))))))))))).)))..))..))).)))..... (-35.80)