mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTTTTGCGGTCTGGGCTTGC AAGCCCTTACCCCAAAAAGTA CCCTTTGGATCTTTTTGCGGTCTGGGCTTGCTGTTCCTCTCTACAGTAGTCAGGAAGCCCTTACCCCAAAAAGTATCTGCGGGA 4 0 5' arm Sus_scrofa mirbase mir-129 6e-36 bta-mir-129-1 2e-35 -34.7 .(((.((((((((((((.(((..((((((.(((..(..((....))..).))).))))))..))).))))))).))))).))). (-34.70)