mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTCCCCTTCAACCAGCTG GCTGGTAAAATGGAACCAAAT TAGAGCTGGTAAAATGGAACCAAATCGCCTCTTCAATGGATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTAGCTATGCAT 5 0 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-133 7e-20 cfa-mir-133a 5e-36 -24.7 ((.(((((((..((.((.((((((((............)))))))).)).))..))))))).))......... (-24.70)