mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGTCCCCTTCAACCAGCTAT GGCTGGTCAAACGGAACCAAGTC CCTGCTCTGGCTGGTCAAACGGAACCAAGTCCGTCTTCCTGAGAGGTTTGGTCCCCTTCAACCAGCTATAGCAGGGCTGG 5 0 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-133 2e-36 cfa-mir-133b 9e-38 -37.9 ((((((.((((((((..((.((.((((((.((.((((...)))))))))))).)).))..)))))))).))))))..... (-37.90)