mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTAGTGTTTCCTACTTTATGG ATAAAGTAGAAAGCACTACTAA GTGCAGTCACCCATAAAGTAGAAAGCACTACTAACAGCACTGGAGGGTGTAGTGTTTCCTACTTTATGGATGAGTGTACT 2 0 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-142 6e-39 mml-mir-142 4e-40 -38.9 (((((.(((.(((((((((((.(((((((((...(..(....)..)..))))))))).))))))))))).))).))))). (-38.90)