mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGTGCAGTGCTGCATCTCTGG TGAGATGAAGCACTGTAGCTC GTCCCCCAGCCGGAGGTGCAGTGCTGCATCTCTGGTCAGCTGGGAGTCTGAGATGAAGCACTGTAGCTCGGGAAGGGAGA 3 0 5' arm Sus_scrofa mirbase mir-143 9e-32 ssc-mir-143 4e-40 -41.8 .((.(((..((.(((.(((((((((.((((((.((((......)).)).)))))).))))))))).))).))..))).)) (-41.80)