mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGAGGAGCTCACAGTCTAGT TAGACTGAAGCTCCTTGAGG TTTTCCTGCCCTCGAGGAGCTCACAGTCTAGTACGTCTCATCCCCTACTAGACTGAAGCTCCTTGAGGACAGGGATCGTC 1 1 5' arm Sus_scrofa mirbase mir-28 1e-33 ssc-mir-151 4e-40 -45.3 ..((((((.((((((((((((..((((((((((.(........).)))))))))).)))))))))))).))))))..... (-45.30)